Pour interpréter ces propriétés différentes les chimistes ont imaginé, au siècle dernier, que les atomes d'une molécule étaient disposés dans l'espace, et que ces dispositions spatiales justifiaient le comportement différent de l'ensemble de la molécule. La classification par fonction chimique, établie selon le comportement des composés fut reliée à la présence dans la molécule d'un groupe d'atomes appelé GROUPE FONCTIONNEL. Ainsi CH4O, C2H6O, C3H8O, qui sont des ALCOOLS virent leur activité chimique attribuée au groupe OH et furent écrits: CH3OH, C2H5OH, C3H7OH.
En plus du rôle du groupe fonctionnel, on s'aperçut du comportement
différent induit par des dispositions légèrement
différentes d'atomes, dans le reste de la molécule, qui
expliquent les diverses classes d'isoméries suivantes.
| C | C | H | H | H | H | H | H | O | |
| C | 1 | 1 | 1 | 1 | |||||
| C | 1 | 1 | 1 | 1 | |||||
| H | 1 | ||||||||
| H | 1 | ||||||||
| H | 1 | ||||||||
| H | 1 | ||||||||
| H | 1 | ||||||||
| H | 1 | ||||||||
| O | 1 | 1 |
Deux isomères "plans" n'ont pas de table de connectivité
identique.
Le problème est plus complexe qu'il n'y parait, car
en plus du nombre importants de tables correspondant à une seule
molécule. La nature des symboles des connection n'est pas claire
à ce niveau et nous n'irons pas plus loin sur ce point. Mais il
faut d'ores et déja savoir qu'il existe des stéréoisomères
qui possédent au moins une table de connectivité identique
et des propriétes différentes. Il s'agit d'une autre famille
d'isomères que nous examinerons au chapitre suivant.
Ex: Ethanol et diméthyléther CH3-CH2-OH
CH3-O-CH3
L'un alcool réagit avec le sodium en donnant un dégagement
d'hydrogène, l'autre éther ne réagit pas avec l'hydrogéne.
Du point de vue physique l'alcool est liquide et bout à
78,5°C, tandis que l'éther est un gaz qui se liquéfie
à -23°C.
Ex: Hexan-2-ol et Hexan-3-ol
Parfois c'est le groupe alkyle (le squelette) qui est disposé différemment (is. de squelette)
Ex: Méthyl-3-Pentan-2-ol et Hexan-2-ol
Enfin les deux cas peuvent se produire simultanément (Méthyl-3-Pentan-2-ol
et Hexan-3-ol).
On appelle souvent du même nom, pour des raisons historiques, les
deux isomères géométriques, qui définissent
ainsi une espèce chimique. Chacun des stéréoisomères
est définit comme une configuration de cette espèce.
cis ou trans anti ou syn
1,3-Dichlorocyclobutane cis 1,3-Dichlorocyclobutane trans
Deux cycles accolés donnent le même type d'isomérie. Par exemple deux cycles à 6 carbones (décaline) ayant un côté commun peuvent être reliés en cis ou en trans par rapport à leur plan moyen. La figure suivante les représente selon les conventions de NEWMANN en conformation "chaise".
trans décaline cis décaline
Avec plus de 2 substituants pour un cycle la question se complique, on recherchera comment classer les 1,3,5-triméthylcyclohexanes et les 1,2,4,5-tétraméthylcyclohexanes en supposant le cycle plan.
ISOMERIES OPTIQUES chap suivant